Не все серверы администрируются. У некоторых забытых могут быть неверно выставлены часы (не переведены на зимнее время в октябре 2014). Хорошая статья о настройке времени в Linux здесь. В моем случае достаточно было обновить пакет tzdata.noarch:

А все остальное, похоже, сделал демон ntpd.